儀器儀表商情網(wǎng)報道 據(jù)最新一期《分子系統(tǒng)生物學(xué)》報道，加拿大研究人員開發(fā)出一種新技術(shù)，可將DNA（脫氧核糖核酸）條形碼拼接在單個細(xì)胞內(nèi)，以同時搜索數(shù)以百萬計蛋白質(zhì)對之間的相互作用。
近年來，DNA條形碼技術(shù)使科學(xué)家開展高并行試驗（許多不同類型的細(xì)胞在同一試管內(nèi)進行試驗）成為可能，而新一代DNA測序技術(shù)的發(fā)展，進一步提高了對條形碼計數(shù)和讀取結(jié)果的效率。
然而，可在同一試管內(nèi)進行的試驗次數(shù)，卻受限于編碼的細(xì)胞類型數(shù)量。一直以來，DNA條形碼都是一維的，也就是一個條形碼只能做一次試驗。允許條形碼在細(xì)胞內(nèi)融合在一起，意味著科學(xué)家們現(xiàn)在可以打破這一障礙。新技術(shù)可顯著提高在單一試管內(nèi)進行的實驗次數(shù)，在同等成本條件下能將效率提高10倍。
在廣泛使用的酵母雙雜交（Y2H）方法中，攜帶一個“誘餌”蛋白的酵母細(xì)胞與攜帶一個“獵物”蛋白的酵母細(xì)胞配對。對Y2H系統(tǒng)進行操縱后，只有“誘餌”與“獵物”蛋白黏在一起的細(xì)胞才能存活，從而使科學(xué)家可以觀察到哪些蛋白間互相關(guān)聯(lián)。在被命名為“條形碼融合遺傳學(xué)—酵母雙雜交（BFG-Y2H）”的新技術(shù)中，攜帶著數(shù)千“誘餌”和“獵物”蛋白的細(xì)胞在同一培養(yǎng)皿中配對。
BFG-Y2H方法的新穎之處在于，通過對細(xì)胞編程，將來自“誘餌”和“獵物”細(xì)胞的DNA條形碼連接在一起，形成一個“融合條形碼”，然后利用新一代DNA測序方法對融合條形碼進行檢測。
研究人員稱，這項研究的最終目標(biāo)，是建立蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的三維視圖，而不是靜態(tài)圖。通過有效建立含有更豐富信息的蛋白相互作用圖譜，BFG-Y2H方法可拓展研究人員對細(xì)胞工作機理的理解，并展現(xiàn)只在某種特定環(huán)境條件下才能發(fā)生的蛋白相互作用，從而加速對基因功能和人類疾病的理解。
