美國(guó)西北大學(xué)的Simone Sredni主要研究一種名為惡性橫紋肌樣瘤的高侵襲性兒童腫瘤，最近她參與了該文庫(kù)的黑盒測(cè)試。Simone使用這一技術(shù)來(lái)篩查160種激酶突變后患者腫瘤細(xì)胞中產(chǎn)生的變化，從而找出影響細(xì)胞增殖和生長(zhǎng)的突變。三個(gè)月后她得到了大部分的數(shù)據(jù)，并且發(fā)現(xiàn)了一些突變后可以減慢細(xì)胞生長(zhǎng)的基因。她僅僅用了一年多一點(diǎn)的時(shí)間，她就已經(jīng)開(kāi)始使用動(dòng)物模型在體內(nèi)測(cè)試這些激酶抑制劑的效果了?！叭绻麤](méi)有這種篩查技術(shù)，我是絕對(duì)不可能做到的?！?/span>
該文庫(kù)有多個(gè)版本。用戶可以從19個(gè)不同的基因集中任意挑選，定制屬于自己的篩選方案，或者對(duì)18,000個(gè)基因進(jìn)行無(wú)差別篩選。“它不僅是市場(chǎng)上最高效的篩查技術(shù)，還在為不同需求構(gòu)建不同實(shí)驗(yàn)方案上給出了很大的可操作空間，”Thermo Fisher Scientific合成生物學(xué)研發(fā)部高級(jí)主管Jon Chesnut說(shuō)道。
Sredni說(shuō)，每個(gè)文庫(kù)售價(jià)10,000美元，可能有些貴，但是對(duì)于想要從事高效篩選的實(shí)驗(yàn)室來(lái)說(shuō)，物有所值。
評(píng)委：任何將CRISPR技術(shù)帶入高通量水平的工作都是值得關(guān)注的。這是一個(gè)很好的輔助系統(tǒng)。雖然你也可以自己組建文庫(kù)，但這個(gè)系統(tǒng)提供了一種尋找基因生理功能的合理方法。
2008年NanoString首次推出了nCounter分析系統(tǒng)，這個(gè)可以識(shí)別特定分子熒光條形碼的自動(dòng)化顯微成像系統(tǒng)，可以對(duì)mRNA進(jìn)行單分子定量檢測(cè)。NanoString計(jì)劃將該技術(shù)從mRNA拓展至DNA序列和蛋白質(zhì)的單分子定量。2016年，該公司終于達(dá)成這一目標(biāo)，推出了nCounter Vantage 3D Panels。
“升級(jí)后的Vantage檢測(cè)系統(tǒng)可以對(duì)mRNA、DNA、蛋白質(zhì)甚至蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行電子計(jì)數(shù)，”NanoString研發(fā)部高級(jí)副總Joe Beechem說(shuō)。2016年4月，NanoString推出了第一款Vantage檢測(cè)系統(tǒng)，該系統(tǒng)可用于對(duì)肺癌和白血病樣本的RNA電子計(jì)數(shù)，也可用于實(shí)體瘤釋放的蛋白質(zhì)和免疫細(xì)胞信號(hào)分子，以及DNA單核苷酸位點(diǎn)突變的檢測(cè)。
德克薩斯大學(xué)MD安德森腫瘤中心系統(tǒng)生物學(xué)部主任Gordon Mills幫助研發(fā)了Vantage系統(tǒng)，并在安德森腫瘤中心扎耶德研究所將其應(yīng)用于癌癥的個(gè)性化治療?！翱捎糜趯?shí)驗(yàn)室檢測(cè)的平臺(tái)很多，”他說(shuō)，“但是沒(méi)有一個(gè)能夠和nCounter Vantage一樣擁有結(jié)果穩(wěn)定性和操作簡(jiǎn)便性，并且可以同時(shí)檢測(cè)患者樣本中的DNA、RNA和蛋白質(zhì)。”
nCounter分析系統(tǒng)售價(jià)149,000至280,000美元，使用nCounter Vantage 3D Panels測(cè)量單個(gè)樣本需花費(fèi)275美元或更多。不久的將來(lái)，NanoString和Mills實(shí)驗(yàn)室計(jì)劃推出能在單細(xì)胞水平上測(cè)繪生物分子空間分布的新版Vantage系統(tǒng)。
評(píng)委：這項(xiàng)技術(shù)可以同時(shí)測(cè)量少量樣品中的DNA、RNA和蛋白質(zhì)豐度，憑借這一點(diǎn)，它有可能成為今年最大的技術(shù)突破。這項(xiàng)技術(shù)推動(dòng)了當(dāng)前的腫瘤學(xué)研究，將來(lái)還有可能被應(yīng)用于其他領(lǐng)域。這是一臺(tái)能夠測(cè)定多達(dá)800種指定DNA、RNA或蛋白質(zhì)的設(shè)備。
